Data management : des compétences indispensables pour le biobanqueur

Publié le 23 mars 2017 Mis à jour le 20 mai 2019

Des échantillons biologiques c'est bien, mais sans les informations associées à ces échantillons ils ne peuvent servir à rien ! Le biobanqueur doit donc être compétent en data management.

Parmi les données qui doivent être conservées au même titre que l'échantillon lui-même : l'origine précise du prélèvement (date, lieu...), l'historique du patient (pour un échantillon humain), les conditions techniques du prélèvement, du transport, du stockage, etc.
Autant de données qui serront utilisées par les chercheurs souhaitant travailler sur cet échantillon.


Le challenge du biobanking est donc de gérer les flux d'échantillons (du prélèvement jusqu'à l'utilisateur final) tout en garantissant la sauvegarde des données associées, dans le respect des règles de bioéthique (anonymisation des données pour les échantillons humains par exemple).



Le master propose donc un modèle de formation au data management et à l'utilisation des bases de données.
Parmi les compétences à acquérir :
  • comprendre le principe d'un logiciel de base de données
  • savoir monter un cahier des charges pour décrire les besoins logiciels de gestion des données
  • être capable d'interagir avec des fournisseurs pour choisir la solution logicielle la plus adaptée
  • pouvoir former les utilisateurs au logiciel retenu (techniciens...)


De nombreuses missions en biobanques intègrent des aspects de data management, par exemple :

Annaëlle a fait un stage dans le service de Biobanque interne à BioMérieux. Ses missions incluaient la formation des autres salariés de BioMérieux amenés à utiliser la base de données associées aux échantillons mis à disposition des différents services.


Audrey a travaillé dans le laboratoire de recherche publique CARMEN à Lyon. Elle est intervenue sur la structuration et la valorisation des échantillons biologiques du laboratoire, et dans ce cadre elle a été entre autres chargée d'identifier une solution logicielle de data management et de la mettre en place dans le laboratoire.

 
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